Please use this identifier to cite or link to this item: http://cimav.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1004/208
ANÁLISIS Y MODELADO MOLECULAR DEL FLUOROFORO, INTERRUPTOR Y SONDA DE UN BIOSENSOR PARA DETECTAR Mycobacterium tuberculosis
SANDRA MONICA ALVARADO GONZALEZ
MARIO DANIEL GLOSSMAN MITNIK
ERASMO ORRANTIA BORUNDA
Acceso Abierto
Atribución
La tuberculosis (tb) es la principal causa de mortalidad a nivel mundial. La tuberculosis, es una enfermedad infecciosa, causada por diferentes especies del genero Mycobacterium, denominado complejo Mycobacterium tuberculosis (Mtb), la especie más importante y representativa, causante de la tuberculosis es Mycobacterium tuberculosis. Debido al lento crecimiento de la Mycobacteria el aislamiento, la identificación y las pruebas de susceptibilidad tardan varias semanas. IS6110 es un elemento de inserción que se encuentra exclusivamente en los miembros del complejo M. tuberculosis y, por su exclusividad, este resulta ser una herramienta de diagnostico muy importante. Los Molecular Beacons (MB) son sondas que hibridan, formada por oligonucleótidos de una sola cadena y forman estructuras de tallo-burbuja y a su vez en los extremos de los brazos del tallo tienen un fluoroforo y un interruptor unidos. Los Molecular Beacons indican la presencia de una ácido nucleico específico. Son sondas que pueden monitorear la síntesis de ácidos nucleicos en tiempo real, acoplados a la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) sin interrupción de la reacción. Cuando los MB están en presencia del DNA blanco sufren un cambio de conformación y fluorescen. Los MB no fluorescen en ausencia del blanco, por lo tanto, el tallo mantiene a estas dos moléculas (fluoroforo e interruptor) muy próximos causando que la fluorescencia del fluoroforo sea interrumpida por la transferencia de energía. Debido a que el interruptor no es fluorescente emite la energía que recibió del fluoroforo en forma de calor. La transferencia de energía del fluoroforo al interruptor en este complejo se lleva a cabo por el mecanismo de Transferencia de Energía por Resonancia de Fluorescencia (FRET), el cual solo ocurre cuando la fluoroforo y el interruptor interactúan a una distancia de (10 a 100 Å). En este trabajo se uso el paquete computacional Modeling Platform (OMP6; DNA Software, Inc.) para obtener los valores teóricos de la temperatura de desnaturalización (Tm) y de la energía libre de Gibbs (ΔG) y predecir teóricamente la temperatura de desnaturalización del biosensor y del blanco. Además se utilizo el paquete computacional Gaussian 03W y Gaussian View 3.09, para describir la interacción del complejo fluoróforo-interruptor empleando la teoría de funcionales de la densidad (DFT).
30-04-2009
Tesis de doctorado
Español
QUÍMICA ANALÍTICA
Versión aceptada
acceptedVersion - Versión aceptada
Appears in Collections:Doctorado en Ciencia de Materiales

Upload archives


File Description SizeFormat 
Tesis Sandra Mónica Alvarado González .pdf16.5 MBAdobe PDFView/Open